1.การจัดเก็บสต็อกไม่มีระบบ
ปัญหาหลักๆ ภายในร้านอาหาร ก็คือการควมคุมวัตถุภายในสต๊อก ที่เจ้าของร้านอาหารหลายๆคนต้องพบเจอเมื่อเปิดธุรกิจร้านอาหาร ก็คือการควบคุมวัตถุภายในสต๊อกที่ไม่มีระบบ ส่งผลทำให้วัตถุดิบในสต๊อกเกิดการเน่าเสียและหมดอายุ ไม่สามารถนำกลับมาใช้ประกอบอาหารได้ เจ้าของร้านจำเป็นต้องจำใจทิ้งวัตถุดิบที่หมดอายุไป ถ้าหากเจ้าของร้านอาหารรู้ว่าในร้านมีวัตถุดิบอะไรบ้าง ต้องซื้ออะไรเติมบ้าง ซึ่งเป็นข้อมูลพื้นฐานที่สำคัญมากในการวางแผนและดำเนินธุรกิจต่อไป

2.ไม่มีการควบคุมวัตถุดิบในแต่ละเมนู
การไม่ควบคุมวัตถุดิบในแต่ละเมนู ส่งผลโดยตรงถึงรายได้ในแต่ละวันอย่างแน่นอน และส่งผลเสียให้กับร้านอาหารและลูกค้าด้วย ในมุมร้านอาหาร บางครั้งพนักงานอาจจะใช้วัตถุดิบที่มากเกินกว่าที่วางไว้ในแต่ละเมนู ซึ่งจะผลต่อสต๊อกโดยตรง เพราะจะทำให้วัตถุดิบในสต๊อกไม่เพียงพอสำหรับเมนูอาหาร หรือในมุมของลูกค้า หากครั้งหนึ่งลูกค้าของคุณเคยมารับประทานอาหารที่ร้าน แล้วประทับใจทั้งในเรื่องรสชาติและปริมาณอาหาร ครั้งต่อไปเมื่อลูกค้ากลับมาทานอีกครั้ง แล้ววัตถุดิบในเมนูอาหาร น้อยลงไปจากครั้งที่แล้ว อาจจะทำให้ลูกค้ารู้สึกความเชื่อถือของร้านลดลง ซึ่งไม่ใช่เรื่องดีแน่นอน

3.พนักงานขาดงานบ่อย
ในธุรกิจร้านอาหาร พนักงานถือว่าเป็นฟันเฟืองสำคัญในการดำเนินธุรกิจร้านอาหาร หากพนักงานมีการลางานไป ทำให้การทำงานในแต่ละวันที่ปกติ ไม่ปกติส่งผลให้การรับลูกค้า หรือการประกอบเมนูอาหาร เกิดความล้าช้ารับลูกค้าไม่ได้มากกว่าเดิม ทำอาหารได้ไม่เท่าเดิม
4.โปรแกรมจัดการร้านอาหารที่ล้าหลัง
ระบบจัดการร้านอาหาร ซึ่งเป็นตัวช่วยในการจัดการร้านอาหารในการทำงานให้สะดวกมาขึ้น ซึ่งปัจจุบันมีระบบ(pos)ในท้องตลาดหลายเจ้าหลายแบรนด์ ซึ่งในแต่ละแบรนด์ก็จะค่าใช้จ่ายรายเดือนไม่เท่ากัน รวมทั้งฟังก์ชั่นในการทำงานที่ได้มาใช้ก็ขึ้นอยู่กับเงินที่จ่ายในแต่ละเดือนอีกด้วย มาตรฐานของโปรแกรมก็มีผลต่อการทำงาน หากระบบมีปัญหาทำงานล่าช้าก็จะส่งผลทำให้การทำงานเกิดความล้าช้า มากกว่าความสะดวก อีกทั่งการซื้ออุปกรณ์เสริมในการทำงานเป็นเพิ่มต้นทุนในการทำงานให้ทางหนึ่ง ซึ่งเจ้าของร้านรายใหม่ควรศึกษาการใช้ระบบจัดการภายในก่อนที่จะลงทุนซื้ออุปกรณ์เข้ามา
